Agentúra zriaďuje odborové rady, rady programov agentúry a radu pre medzinárodnú vedecko-technickú spoluprácu.
Rada má najmenej sedem členov, ktorí sú významnými odborníkmi v oblasti jej pôsobnosti. Členom rady je aspoň jeden zahraničný odborník.
Zoznam rád agentúry
-
Rada pre prírodné vedy
-
Rada pre technické vedy
-
Rada pre lekárske vedy
-
Rada pre pôdohospodárske vedy
-
Rada pre spoločenské vedy
-
Rada pre humanitné vedy
-
Rada pre medzinárodnú vedecko-technickú spoluprácu (MVTS)
-
Rada pre program Podpora ľudského potenciálu v oblasti výskumu a vývoja a popularizácia vedy (LPP)
-
Rada pre program Podpora spolupráce univerzít a SAV s podnikateľským prostredím (SUSPP)
-
Rada pre program Podpora výskumu a vývoja v malých a stredných podnikoch (VMSP)
